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小保方さんだけじゃなかった!早稲田大学の博士論文のコピペが次々と発覚!

早稲田大学の研究室で書かれた博士論文において、大量のコピペが見つかる事件が起こっています。早稲田大学の博士論文の多くが他の大学からのコピペで成立していた事で、大学の信頼性が失墜する事態に陥っています。

更新日: 2014年03月25日

misukiruさん

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日本のコピペランキング

【1位】松本慎也氏  約50000文字 7400単語、20ページ分(早稲田大 先進 RICOH学部 常田研)
【2位】古川和寛氏  約30000文字 4700単語(早稲田大 先進 RICOH学部 常田研)
【3位】小保方晴子氏 約30000文字 4600単語(早稲田大 先進 RICOH学部 常田研)

STAP細胞論文の小保方晴子氏(30)が学んだ早大の研究室などの出身者に対し、博士論文のコピペ疑惑がネット上で次々に上がっている

新たに、早稲田大学の常田聡氏の研究室の古川和寛氏の博士論文において大規模コピペが発覚。他人(東大の寺井氏ら)の論文ほぼ丸ごと(12,000文字、2000単語以上)を無断コピペ。早稲田では想像以上に盗用・剽窃の文化が普及している模様。 stapcells.blogspot.com/2014/03/blog-p…

さらに、この早稲田大学の常田研の古川氏の博士論文のFig.1-4, 1-5, 1-6は、寺井論文(Curr Opin Chem Biol. 2008)のFig.1, 2, 3 から拝借しわずかに改変しただけのものです。また、寺井論文に関する引用情報もありません。

早稲田大学では、博士論文の背景(Intro、Background)は他人の論文をコピペ(盗用、剽窃)しても良いという文化が普及しており、そのような中で学んでしまうと、小保方氏のように感覚が麻痺し、背景以外のResult部分でも盗用・捏造・改竄してしまうに至るのではないでしょうか

早稲田大学の常田聡研究室(小保方晴子氏の大学時代の指導教員)の松本慎也氏の博士論文は、第1章Introductionの20行文の文章が、オランダの研究者Picioreanuらの論文(Biofilms, 2004)の文章からの盗用です。 stapcells.blogspot.com/2014/03/blog-p…

現在は国立大学の助教をしている男性も、同時期の論文で、当時の東大助教が08年に書いた論文のうち、イントロの英文2000単語以上を無断でコピペしたなどの疑いがいくつか見つかった。

ネット上では、早大理工学部出身という匿名ブロガーが大学でのコピペの実態を明かすなどして話題になっている。

松本慎也氏(早稲田大学の常田聡氏の研究室)

同一文章 :松本氏の論文の1.1の項の文章。黄色でハイライトされた部分がPicioreanu氏らの論文との同一文章です。
During biofilm development, a large number of phenomena occur simultaneously and interact over a wide range of length and time scales. As a result of nutrient
conversions, the biofilm expands on the basis of bacterial growth and production of
extracellular polymeric substances (EPS). Chemical species need to be ontinuously
transported to and from the biofilm system by physical processes such as olecular
diffusion and convection. Fluid flow influences biofilm growth by determining the
concentrations of available substrates and products. On the other hand, the flow also shears the biofilm surface, and determines biofilm detachment processes. In the case of multi-species systems, microorganisms of different species interact in complex relationships of competition or cooperation. All these linked phenomena create a dynamic picture of the biofilm three-dimensional (3D) structure. The large number of localized interactions poses an important challenge for experimentalists. Mathematical models can prove useful because they allow testing of hypotheses and, in addition, can direct experimental efforts to complex regions of operation that can easily confound the general intuition. Although the word “modeling” is used for different purposes, the final result is invariably the same: models are no more than a simplified representation of reality based on hypotheses and equations used to rationalize observations. By providing a rational environment, models can lead to deeper and more general understanding. Ultimately, understanding the underlying principles becomes refined to such a state that it is possible to make accurate predictions.
http://stapcells.blogspot.jp/2014/03/blog-post_15.html

古川和寛氏(早稲田大学の常田聡氏の研究室)

FISH probes several hundreds or thousands of nucleotides long complementary to nearly the entire 16S or 23S rRNA and containing multiple fluorophore labels have long been used to detect microorganisms in environmental samples because such lengthy probes offer reliable hybridization and intense signal. These probes are prepared enzymatically, typically by PCR [28] or in vitro transcription [29, 30], at which time multiple fluorophores are incorporated. Although polynucleotide probes allow the visualization of a significantly higher percentage of prokaryotes in a sample compared to singly labeled oligonucleotide probes [31], polynucleotide probes are only able to discriminate between distantly related groups, such as Bacteria, Crenarchaeota, and Euryarchaeota [32], because their sensitivity to small sequence differences is very low. Furthermore, long polynucleotide probes must be produced in the laboratory using costand labor-intensive protocols. Typical problems encountered include nonspecific binding of probe [32], high autofluorescence vs specific fluorescence [33], poor signal-to-background [34], low cellular detection compared to total cell count [35], and enzymatic degradation in situ [36].

More commonly, RNA-targeted FISH probes employ oligonucleotides 15–30 nucleotides long, with a DNA, PNA, or modified nucleic acid backbone, prepared synthetically (Fig. 1.1.A). Fluorescence is typically observed directly, using a fluorophore attached to the 5′-terminus, though in some cases 3′- or internally labeled probes are used. Common fluorophores used in RNA-targeted FISH diagnostics include fluorescein, tetramethylrhodamine (TAMRA), Texas Red, Cy3, and Cy5. Choice of dye is typically determined by its spectral properties and the availability of equipment for imaging. Labeled oligonucleotides are available from a variety of commercial sources, so it is typically not necessary for investigators to synthesize or purify probes.In some applications, indirect sensing is used instead of directly coupling the fluorophore to the probe. Indirect sensing strategies typically involve coupling an enzyme to the oligonucleotide probe, hybridizing to targets, then adding a fluorophore moiety that is recognized by and covalently binds to the enzyme [37]. These approaches can offer the significant advantage of brighter signals, but they tend to have low specificity [38, 39]. The most well-studied approach employs horseradish peroxidase (HRP)-labeled oligonucleotide probes [40-43]. HRP reacts with hydrogen peroxide and tyramide to produce a free radical on the tyramide, which covalently binds to a nearby tyrosine residue (Fig. 1.1.B) [44, 45]. A number of fluorophore-conjugated tyramides are available, thus allowing fluorescence detection of enzymatically deposited tyramide [45].
http://stapcells.blogspot.jp/2014/03/blog-post_15.html

寺原猛氏(早稲田大学の常田聡氏の研究室)

寺原猛氏の博士論文の "1.3 The principles, advantages, and disadvantages of fingerprinting techniques"の項、 pp.8-9はコピペです。 一応引用はふっており、導入部分の1文目に(10)として下の文献を引用している。しがって、その文についてのみ参照したかのようですが、実際にはそこから2ページ分ほぼ丸ごとコピペ。

Ikeda, S., N. Ytow, H. Ezura, K. Minamisawa, and T. Fujimura. 2006. Soil microbial community analysis in the environmental risk assessment of transgenic plants. Plant Biotechnol 23:137-151. (被コピペ部分はp.143の最終項からp.144の大部分)

 さらに、脚注番号がふってある導入部分の冒頭の文自体もほぼコピペですが、元の文献で "There are ”four” principal fingerprinting techniques...."となっているのを "There are ”three” principal fingerprinting techniques...."と改ざんした上で脚注番号をつけており、別の違反があります。(anさんによる指摘: 2014年3月17日 8:24)
http://stapcells.blogspot.jp/2014/03/blog-post_15.html

岸田直裕氏(早稲田大学の常田聡氏の研究室)

Nitrification implies a chemolithoautotrophic oxidation of ammonia to nitrate under strict aerobic conditions and is conducted in two sequential oxidative stages: ammonia to nitrite (ammonia oxidation) and nitrite to nitrate (nitrite oxidation). Each stage is performed by different bacterial genera that use ammonia or nitrite as an energy source and molecular oxygen as an electron acceptor, while carbon dioxide is used as a carbon source. The most commonly recognized genus of bacteria that carries out ammonia oxidation is Nitrosomonas; however, Nitrosococcus, Nitrosopira, Nitrosovibrio and Nitrosolobus are also able to oxidize ammonium to nitrite. These ammonium oxidizers are genetically diverse, but related to each other in the beta subdivision of the Proteobacteria. In the nitrite oxidation stage, several genera such as Nitrospira, Nitrospina, Nitrococcus, and Nitrocystis are known to be involved. However, the most famous nitrite oxidizer genus is Nitrobacter, which is closely related genetically within the alpha subdivision of the Proteobacteria (Teske et al., 1994; Rittmann and McCarty, 2001). Equations for synthetic-oxidation using a representative measurement of yield and oxygen consumption for Nitrosomonas and Nitrobacter are as follows (U.S. Environmental Protection Agency, 1975).

副島孝一氏(早稲田大学の常田聡氏の研究室)

↓ 副島孝一氏の博士論文の第一章の1.1 水環境の現状の文章前半
1.1 水環境の現状
 水環境については,水質汚濁の防止,水辺空間の利用の観点からの対策のみならず,水質,水量,水生生物,水辺地等を総合的に捉えた保全対策を推進する必要がある。水は雨となって地上に降り注ぎ森林や土壌・地下水に保水され川をくだり海に注ぎ蒸発して再び雨になるという自然の循環過程の中にあり,その過程で多くの汚濁物質が浄化される。我々の水利用に伴う環境への負荷が自然循環の浄化能力を超えることがないよう,また大気環境や土壌環境を通じた水環境への負荷や水環境の悪化に伴う大気環境や生態系への影響にも配慮した健全な水循環の確保が重要である。また,我々は急峻な地形や狭小な国土という地理的特徴のために生じる,流量の変動の大きな河川等厳しい条件下において水利用を行っている。その水利用は,大気から河川,海域等に向かうまでの間,水資源として開発・供給されること等を通じてさまざまな形で何度も行われ,その後自然の循環に戻される。この過程で水環境に大きな影響を与え,かつ,土壌,生態系等にも影響を与えていることから,これらにも配慮した水環境の保全が必須である。

↓ 環境庁の環境白書 第3節 1 水環境、土壌環境、地盤環境の現状の文章
(1)水環境の保全
 水環境については、水質汚濁の防止、水辺空間の利用の観点からの対策のみならず、水質、水量、水生生物、水辺地などを総合的に捉えた保全対策を推進する必要があります。水は雨となって地上に降り注ぎ、森林や土壌・地下水に保水され、川を下り、海に注ぎ、蒸発して再び雨になるという自然の循環過程の中にあり、その過程で多くの汚濁物質が浄化されます。私たちの水利用に伴う環境への負荷が自然循環の浄化能力を超えることがないよう、また大気環境や土壌環境を通じた水環境への負荷や水環境の悪化に伴う大気環境や生態系への影響にも配慮した、健全な水循環の確保が重要です。
 また、私たちは、急峻な地形や狭小な国土という地理的特徴のために生じる、流量の変動の大きな河川等厳しい条件下において水利用を行っています。その水利用は、大気から河川、海域等に向かうまでの間、水資源として開発・供給されること等を通じてさまざまな形で何度も行われ、その後自然の循環に戻されます。この過程で水環境に大きな影響を与え、かつ、土壌、生態系等にも影響を与えていることから、これらにも配慮した水環境の保全が重要です。

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